Ruang Pengolahan Perpustakaan STAIN Kudus adalah ruang yang ditempatkan di dalamnya proses pengolahan pustaka baru atau pustaka yang akan diperbaiki. Tiga orang pustakawati yang ada di ruang pengolahan ini sepenuhnya memiliki kewajiban penuh untuk mengolah data pustaka yang akan dimasukkan atau yang akan disiangi oleh Perpustakaan STAIN Kudus.